Rossi je pole-position za nedjeljnu utrku ostvario najbržim krugom kvalifikacija kojeg je prošao u vremenu 2:00.518. Talijanski motociklist time je za 0.087 sekundi srušio rekord staze koji je sam postavio 2006. godine u natjecanju do 990 ccm.
Drugo mjesto pripalo je njegovom momčadskom kolegi, Španjolcu Jorgeu Lorenzu s 0.569 sekundi zaostatka, dok će kao treći u utrku startati još jedan španjolski as Dani Pedrosa. Vozač Repsol Honde zaostao je 0.167 sekundi za sunarodnjakom.
Rossi će već u Sepangu imati priliku za obranu naslova svjetskog prvaka i svoj ukupno sedmi naslov u prestižnoj klasi koju je osvajao 2001., 2002., 2003., 2004., 2005. i 2008. godine. Pridodamo li mu naslove iz nižih klasa (125 i 250 ccm) trenutačno je na brojci od osam osvojenih svjetskih prvenstava.
Velika nagrada Malezije, kvalifikacijski trening:
1. Valentino Rossi Yamaha 2:00.518
2. Jorge Lorenzo Yamaha + 0.569
3. Dani Pedrosa Honda + 0.736
4. Casey Stoner Ducati + 0.937
5. Loris Capirossi Suzuki + 1.198
6. Toni Elias Gresini Honda + 1.400
7. Nicky Hayden Ducati + 1.462
8. Randy de Puniet LCR Honda + 1.580
9. Colin Edwards Tech 3 Yamaha + 1.677
10. Alex de Angelis Gresini Honda + 1.756