Treća fatimska tajna, koju je Gospa prilikom svog ukazanja u Fatimi 13. svibnja 1903. povjerila djeci vidiocima, bila je vezana uz papu Ivana Pavla II. i atentat na njega koji je 13. svibnja 1981. izvršio Ali Agca. To se u javnosti doznalo tek 2000., kada je Katolička crkva objasnila da se ta tajna prema tumačenjima odnosi na atentat na papu. Gospa je vidiocima kazala da će biskup u bijelome biti u krvi, a to je u svom pismu objasnila vidjelica Lucija koja se zaredila.
Papa Ivan Pavao II. posjetio je Gospino svetište u Fatimi 13. svibnja 1982., točno na godišnjicu Gospina ukazanja i godinu poslije atentata. Mediji su tada izvještavali da je papa uoči puta u Fatimu izjavio da se ide moliti Gospi za mir u svijetu. On se tom prilikom susreo s vidjelicom Lucijom.
Od tri tajne koje je na početku prošlog stoljeća Gospa povjerila svojim vidiocima u Fatimi, dvije su objelodanjene dosta rano, a posljednja se čuvala gotovo sto godina. Zanimljivo je istaknuti da je Fatimu posjetio i papa Ivan Pavao VI., i to 1967., ali tom se prilikom nije susreo s vidjelicom Lucijom.