Poplavom su u Vukovarsko-srijemskoj županiji zahvaćene velike površine obrađenog zemljišta pod poljoprivrednim usjevima, poglavito pšenicom, ječmom, zobi, ali i drugim usjevima pa je Ministarstvo poljoprivredu izdalo naputak kako obrađivati zemlju nakon povlačenja vode.
Za površine pod usjevima koji nisu u potpunosti uništeni poplavom, savjetuje Ministarstvo poljoprivrede, valja pričekati rezultate mikrobiološke analize tla kao i analize tla na teške metale. Ukoliko se analizama pokaže da tlo, prema službeno propisanim parametrima, nije pogodno za poljoprivrednu proizvodnju, usjeve s tako onečišćenih poljoprivrednih površina ne smije se koristiti za ishranu ljudi ili stoke. Obvezno ih je zaorati dodavanjem 100 kilograma "uree" po hektaru i tonu po hektaru materijala za kalcizaciju, vapnjenje. Ukoliko se analizama tla pokaže da tlo nije onečišćeno te ukoliko kulture ne pokazuju znakove oštećenja ili bolesti, zemlja se smije koristiti i obrađivati kako je uobičajeno planirano.
Ministarstvo poljoprivrede također nalaže da ako posjednik uoči na usjevima pojavu biljnih bolesti ili štetnika ili posumnja da su usjevi zaraženi štetnim organizmima zbog kojih je upitna uporaba za ishranu ljudi ili životinja, obvezno se javiti stručnim službama.